-
Główne zagadnienia wokół których koncentrują się badania prowadzone w Pracowni Biochemii Morza to:
- izolacja i identyfikacja sideroforów, naturalnych chelatów żelaza
- izolacja i identyfikacja karotenoidów w różnych składowych środowiska morskiego
-
Biotechnologia morska
- organizmy morskie (glony i cyjanobakterie) jako źródło produktów o wysokiej wartości dodanej
- zastosowanie peptydomiki w badaniach środowiskowych oraz poszukiwaniu związków o potencjalnym wykorzystaniu jako farmaceutyki
- biotoksyny glonów i sinic.
Wpływ abiotycznych czynników na ekofizjologiczne procesy zachodzące w komórkach fitoplanktonu, jak: wzrost, fotosyntezę, skład barwników oraz transport metali, głównie żelaza, przez błony komórkowe glonów i cyjanobakterii.
Allelopatyczne oddziaływania między gatunkami fitoplanktonu.
Kolekcja Kultur Microglonów i Bakterii - IO PAN Sopot - Pracownia Biochemii Morza
- rozwój i utrzymywanie kolekcji (hodowle akseniczne), w skład której wchodzą izolowane z wód Zatoki Gdańskiej zielenice:
- Chlorella vulgaris (A1-76),
-
Dictyosphaerium pulchellum (C2-79),
-
Scenedesmus armatus (B1-76),
-
Scenedesmus microspina (B2-76),
bakterie heterotroficzne izolowane z wód Bałtyku Południowego
(Heterotrophic bacteria from brackish water of the Southern Baltic Sea - Culture Collection IO PAN
Tab. 16S rDNA – based identification of bacterial isolates (references 1;2)
Strain number |
Sequence similarity [%] |
Closest matching organism in GenBank (accession number) |
References |
1 |
100 |
(Solibacillus silvestris AJ006086)
Re-examination of the taxonomic position of Bacillus silvestris
|
Rheims et al. 1999; Krishnamurthi et al. 2009 |
2 |
96 |
Pontibacter actiniarum (AY989908) |
Nedeshkovskaya et al. 2005 |
3 |
99 |
Erythrobacter vulgaris strain 022 4–7 (AY706938) |
Ivanova et al. 2005 |
|
|
Erythrobacter vulgaris strain 022 2–12 (AY706937) |
|
|
|
Erythrobacter vulgaris strain 022 2–10 (AY706935) |
|
|
|
Erythrobacter sp. MB-16 (AF325446) |
Francis et al. 2001 |
|
|
Alpha proteobacterium MBIC2351 (AB012061) |
Hamada et al. unpublished |
4 |
99 |
Micrococcus luteus (AF542073) |
Tang & Gillevet 2003 |
5 |
99 |
Erythrobacter flavus strain SW-52 (AF500005) |
Yoon et al. 2003 |
|
|
Erythrobacter flavus strain SW-46 (AF50004) |
|
|
|
Erythrobacter citreus (AF118020) |
Vybiral et al. 1999 |
6 |
98 |
Aurantimonas coralicida strain WP1 (AY065627) |
Denner et al. 2003 |
|
|
Fulvimarina litoralis strain HTCC2156 (AY178863) |
Cho & Giovannoni 2003 |
References
- Cabaj A., Palińska K., Kosakowska A., Kurlenda J., Biochemical and molecular identification and characterization of heterotrophic bacteria from brackish water of the Southern Baltic Sea, Oceanologia, 2006, 48(4), 525-543
- Cabaj A., Kosakowska A., Iron-dependent growth of and siderophore production by two heterotrophic bacteria isolated from brackish water of the southern Baltic Sea, Microbiological Research, 2009, 164, 570-577
Inne szczepy mikroglonów i cyjanobakterii pozyskiwane są z kolekcji krajowych i międzynarodowych do celów badawczych i dydaktycznych w zależności o prowadzonej tematyki badawczej m.in. Kolekcja ATCC, Kolekcja Pasteura oraz izolowane są z wód Zatoki Gdańskiej.
Mutanty bakterii stosowane do testów biologicznych- identyfikacja związków o charakterze sideroforów - substancji transportujących żelazo – pozyskane z Instytutu Kocha w Wernigerode (Niemcy)
|